Силоҳи нав барои ташхиси сил ва муайян кардани муқовимат ба дору: Тартибдиҳии мақсадноки насли нав (tNGS) дар якҷоягӣ бо омӯзиши мошинӣ барои ташхиси ҳассосияти баланди сил
Ҳисоботи адабиёт: CCa: модели ташхисӣ, ки бар асоси tNGS ва омӯзиши мошинӣ асос ёфтааст, ки барои одамоне, ки сили бактериявӣ ва менингити силӣ камтар доранд, мувофиқ аст.
Унвони рисола: Секвенсиякунонии насли ояндаи мақсадноки сил ва омӯзиши мошинӣ: стратегияи ташхисии ултраҳассос барои найчаҳои шуши шуш ва менингити найчавӣ.
Нашрияи даврӣ: 《Clinica Chimica Acta》
Агар：6.5
Санаи нашр: Январи соли 2024
Ширкати Macro & Micro-Test якҷоя бо Донишгоҳи Академияи илмҳои Чин ва Беморхонаи синаи Пекини Донишгоҳи тиббии пойтахт модели ташхиси силро дар асоси технологияи насли нави секвенсияҳои мақсаднок (tNGS) ва усули омӯзиши мошинӣ таъсис дод, ки ҳассосияти ултрабаландро барои сил бо бактерияҳои кам ва менингити силӣ таъмин кард, усули нави ташхиси ҳассосияти баландро барои ташхиси клиникии ду намуди сил фароҳам овард ва ба ташхиси дақиқ, муайян кардани муқовимат ба дору ва табобати сил мусоидат кард. Дар айни замон, муайян карда шуд, ки cfDNA-и плазмаи бемор метавонад ҳамчун як намуди намунаи мувофиқ барои намунагирии клиникӣ ҳангоми ташхиси бемории сил истифода шавад.
Дар ин таҳқиқот, 227 намунаи плазма ва моеъи мағзи сар барои таъсиси ду когорти клиникӣ истифода шуданд, ки дар он намунаҳои когорти ташхисии лабораторӣ барои муқаррар кардани модели омӯзиши мошинии ташхиси сил ва намунаҳои когорти ташхисии клиникӣ барои тасдиқи модели ташхисии муқарраршуда истифода шуданд. Ҳамаи намунаҳо аввал аз ҷониби ҳавзи зонди мақсадноки дастгиркунӣ барои Mycobacterium tuberculosis ҳадаф қарор гирифтанд. Сипас, дар асоси маълумоти пайдарпайии TB-tNGS, модели дарахти қарор барои анҷом додани тасдиқи 5-каратаи салиб дар маҷмӯаҳои омӯзишӣ ва тасдиқи навбати ташхиси лабораторӣ истифода мешавад ва остонаҳои ташхисии намунаҳои плазма ва намунаҳои моеъи мағзи сар ба даст оварда мешаванд. Остонаи бадастомада барои муайян кардан ба ду маҷмӯаи санҷиши навбати ташхиси клиникӣ ворид карда мешавад ва фаъолияти ташхисии омӯзанда бо истифода аз каҷи ROC арзёбӣ карда мешавад. Дар ниҳоят, модели ташхиси сил ба даст оварда шуд.
Расми 1. Диаграммаи схематикии тарҳи тадқиқотӣ
Натиҷаҳо: Мувофиқи остонаҳои мушаххаси намунаи ДНК-и CSF (AUC = 0.974) ва намунаи cfDNA-и плазма (AUC = 0.908), ки дар ин таҳқиқот муайян шудаанд, дар байни 227 намуна ҳассосияти намунаи CSF 97.01%, хосият 95.65% ва ҳассосият ва хосияти намунаи плазма 82.61% ва 86.36% буданд. Дар таҳлили 44 намунаи ҷуфтшудаи ДНК-и cfDNA-и плазма ва моеъи мағзи сар аз беморони гирифтори TBM, стратегияи ташхисии ин таҳқиқот мутобиқати баланди 90.91% (40/44) дар ДНК-и cfDNA-и плазма ва моеъи мағзи сар дорад ва ҳассосият 95.45% (42/44) аст. Дар кӯдакони гирифтори сили шуш, стратегияи ташхисии ин таҳқиқот нисбат ба натиҷаҳои ошкоркунии Xpert намунаҳои шарбати меъда аз ҳамон беморон (28.57% VS 15.38%) ба намунаҳои плазма ҳассостар аст.
Расми 2. Таҳлили самаранокии модели ташхиси сил барои намунаҳои аҳолӣ
Расми 3 Натиҷаҳои ташхисии намунаҳои ҷуфтшуда
Хулоса: Дар ин таҳқиқот усули ташхиси ҳассосияти баланд барои сил муқаррар карда шуд, ки метавонад асбоби ташхисиро бо ҳассосияти баландтарини ошкоркунӣ барои беморони клиникӣ бо сили олигобациллярӣ (фарҳанги манфӣ) таъмин намояд. Муайян кардани сили ҳассосияти баланд дар асоси ДНК-и плазмавии cfDNA метавонад як навъи намунаи мувофиқ барои ташхиси сили фаъол ва менингити сил бошад (ҷамъоварии намунаҳои плазма нисбат ба моеъи мағзи сар барои беморони гумонбар ба сили мағзи сар осонтар аст).
Пайванди аслӣ: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? тавассути%3Dihub
Муқаддимаи мухтасари маҳсулоти муайянкунии силсилаи сил дар Macro & Micro-Test
Бо назардошти вазъияти мураккаби намунавии беморони гирифтори сил ва ниёзҳои гуногун, Macro & Micro-Test маҷмӯи пурраи ҳалли NGS-ро барои истихроҷи моеъкунӣ аз намунаҳои балғам, сохтани китобхона ва пайдарпайии Qualcomm ва таҳлили маълумот пешниҳод мекунад. Маҳсулот ташхиси фаврии беморони сил, муайян кардани муқовимат ба доруи сил, типи микобактерияи туберкулез ва NTM, ташхиси ҳассосияти баланд дар сили бактериявӣ-манфӣ ва одамони гирифтори сил ва ғайраро дар бар мегиранд.
Маҷмӯаҳои муайянкунии силсилавӣ барои сил ва микобактерияҳо:
| Рақами ашё | номи маҳсулот | мундариҷаи санҷиши маҳсулот | навъи намуна | модели татбиқшаванда |
| HWTS-3012 | Агенти озодкунии намуна | Дар табобати моеъгардонии намунаҳои балғам истифода мешавад ва рақами рекордии дараҷаи аввал, Sutong Machinery Equipment 20230047-ро ба даст овардааст. | балғам | |
| HWTS-NGS-P00021 | Маҷмӯаи муайянкунии миқдори Qualcomm барои сили ҳассосияти баланд (усули гирифтани зонд) | Муайян кардани ҳассосияти ғайриинвазивӣ (биопсияи моеъ) барои сили шуш, ки бактерияҳо ва гиреҳҳои мағзи сар доранд; Намунаҳои одамоне, ки гумон меравад ба микобактерияҳои сил ё ғайрисил сироят ёфтаанд, бо истифода аз метагеномикаи пайдарпайии амиқи баланд таҳлил карда шуданд ва маълумоти муайянкунӣ дар бораи сироят ёфтани микобактерияҳои сил ё ғайрисил ва маълумоти асосии муқовимат ба доруҳои сатри аввал аз микобактерияи туберкулез пешниҳод карда шуданд. | Хуни периферӣ, моеъи лаважи алвеолярӣ, гидроторакс ва асцит, намунаи пунксияи фокусӣ, моеъи мағзи сар. | Насли дуюм |
| HWTS-NGS-T001 | Маҷмӯаи муайянкунии типикунонии микобактерия ва муқовимат ба дору (усули пайдарпайии амплификацияи мултиплексӣ) | Санҷиши типикунонии Mycobacterium, аз ҷумла MTBC ва 187 NTM；Муайян кардани муқовимат ба доруи Mycobacterium tuberculosis 13 дору ва 16 макони мутатсияи асосии генҳои муқовимат ба доруро дар бар мегирад. | Балғам, моеъи лаважи алвеолярӣ, гидроторакс ва асцит, намунаи пунксияи фокусӣ, моеъи мағзи сар. | Платформаи дугонаи насли дуюм/сеюм |
Нуктаҳои муҳим: Маҷмӯаи муайянкунии типи микобактерия ва муқовимат ба дорувории HWTS-NGS-T001 (усули тақвияти мултиплексӣ)
Муаррифии маҳсулот
Ин маҳсулот бар асоси доруҳои асосии сатри аввал ва дуюм, ки дар дастурҳои табобати бемории сили ТУТ тавсиф шудаанд, макролидҳо ва аминогликозидҳо, ки маъмулан дар дастурҳои табобати NTM истифода мешаванд, таҳия шудааст ва мавзеъҳои муқовимат ба дору ҳамаи як гурӯҳи мавзеъҳои марбут ба муқовимат ба доруро дар каталоги мутатсияи комплекси Mycobacterium tuberculosis-и ТУТ, инчунин дигар генҳо ва мавзеъҳои мутатсияи гузоришшудаи муқовимат ба доруро мувофиқи таҳқиқот ва омори адабиёти баландсифат дар дохил ва хориҷи кишвар фаро мегиранд.
Муайянкунии типизатсия ба штаммҳои NTM, ки дар дастурҳои NTM, ки аз ҷониби Маҷаллаи чинии бемориҳои сил ва роҳи нафас нашр шудаанд, ҷамъбаст шудаанд ва ба мувофиқаи коршиносон асос ёфтааст. Праймерҳои типсозии тарҳрезишуда метавонанд зиёда аз 190 намуди NTM-ро тақвият, пайдарпайӣ ва шарҳ диҳанд.
Тавассути технологияи амплификацияи PCR-и мултиплексии мақсаднок, генҳои генотипсозӣ ва генҳои ба дору тобовар Mycobacterium бо PCR-и мултиплексӣ амплификация карда шуданд ва комбинатсияи ампликонии генҳои мақсаднок, ки бояд муайян карда шаванд, ба даст оварда шуданд. Маҳсулоти амплификацияшударо метавон ба китобхонаҳои секвенсияи насли дуюм ё насли сеюм бо суръати баланд сохтан мумкин аст ва ҳамаи платформаҳои секвенсияи насли дуюм ва насли сеюмро метавон барои ба даст овардани маълумоти пайдарпайии генҳои мақсаднок ба секвенсияи амиқтари баланд гузошт. Бо муқоиса бо мутатсияҳои маълум, ки дар пойгоҳи додаҳои истинодии дарунсохт мавҷуданд (аз ҷумла каталоги мутатсияи комплекси Mycobacterium tuberculosis-и ТУТ ва робитаи он бо муқовимати дору), мутатсияҳои марбут ба муқовимати дору ё ҳассосияти доруҳои зидди сил муайян карда шуданд. Дар якҷоягӣ бо ҳалли худкушодаи табобати намунаи балғами Macro & Micro-Test, мушкили самаранокии пасти амплификацияи кислотаи нуклеинӣ дар намунаҳои клиникии балғам (даҳ маротиба зиёдтар аз усулҳои анъанавӣ) ҳал карда шуд, то муайян кардани секвенсияи секвенсияи муқовимати дору мустақиман ба намунаҳои клиникии балғам татбиқ карда шавад.
Диапазони муайянкунии маҳсулот
34генҳои марбут ба муқовимат ба доруворӣ18доруҳои зидди сил ва6Маводи мухаддири NTM ошкор карда шуданд, ки онҳоро фаро мегиранд297минтақаҳои муқовимат ба дору; Даҳ намуди Mycobacterium tuberculosis ва зиёда аз он190намудҳои NTM ошкор карда шуданд.
Ҷадвали 1: Маълумот дар бораи доруҳои 18+6 +190+NTM
Бартарии маҳсулот
Мутобиқшавии қавии клиникӣ: намунаҳои балғамро метавон мустақиман бо истифода аз агенти худмоякунанда бе парвариш муайян кард.
Амалиёти таҷрибавӣ содда аст: даври аввали амалиёти тақвият содда аст ва сохтмони китобхона дар 3 соат ба анҷом мерасад, ки самаранокии корро беҳтар мекунад.
Навиштани ҳамаҷониба ва муқовимат ба дору: фарогирии мавзеъҳои навиштан ва муқовимат ба дору дар MTB ва NTM, ки нуқтаҳои асосии нигаронии клиникӣ мебошанд, муайянкунии дақиқи навиштан ва муқовимат ба дору, дастгирии нармафзори мустақили таҳлил ва тавлиди гузоришҳои таҳлил бо як клик.
Мутобиқат: мутобиқати маҳсулот, мутобиқшавӣ ба платформаҳои асосии ILM ва MGI/ONT.
Мушаххасоти маҳсулот
| Рамзи маҳсулот | номи маҳсулот | Платформаи ошкоркунӣ | мушаххасот |
| HWTS-NGS-T001 | Маҷмӯаи муайянкунии типикунонии микобактерия ва муқовимат ба дору (усули амплификацияи мултиплексӣ) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Вақти нашр: 23 январи соли 2024