Силоҳи нав барои ташхиси бемории сил ва муқовимат ба маводи мухаддир: пайдарпаии насли нав (tNGS) дар якҷоягӣ бо омӯзиши мошинӣ барои ташхиси ҳассосияти шадиди бемории сил
Ҳисоботи адабиёт: CCa: модели ташхисӣ дар асоси tNGS ва омӯзиши мошинсозӣ, ки барои одамони камтар гирифтори бемории сили бактериявӣ ва менингитҳои сил мувофиқ аст.
Сарлавҳаи рисола: пайдарпаии насли ояндаи сил ва омӯзиши мошинсозӣ: стратегияи ташхиси ултра ҳассос барои найчаҳои шуш ва менингитҳои қубурӣ.
Нашрияи даврӣ: 《Clinica Chimica Acta》
АГАР: 6.5
Санаи нашр: январи соли 2024
Якҷоя бо Донишгоҳи Академияи илмҳои Чин ва Беморхонаи сина дар Пекини Донишгоҳи тиббии пойтахт, Macro & Micro-Test як модели ташхиси бемории силро дар асоси насли нави технологияи пайдарпайии мақсаднок (tNGS) ва усули омӯзиши мошинсозӣ таъсис дод, ки ҳассосияти ултра баланд барои ошкор кардани силро бо шумораи ками бактерияҳо ва усули нави ташхиси менингитҳои силро таъмин кард. сил, ва барои ташхиси дақиқ, муайян кардани муқовимат ба дору ва табобати бемории сил кумак кард. Ҳамзамон, муайян карда мешавад, ки cfDNA-и плазмаи бемор метавонад ҳамчун як намуди мувофиқ барои намунаи клиникӣ дар ташхиси ТБМ истифода шавад.
Дар ин тадқиқот 227 намунаи плазма ва намунаҳои моеъи мағзи сар барои таъсиси ду гурӯҳи клиникӣ истифода шуданд, ки дар онҳо намунаҳои когорти ташхисии лабораторӣ барои муқаррар кардани модели омӯзиши мошини ташхиси бемории сил ва намунаҳои когорти клиникии ташхисӣ барои тасдиқи модели муқарраршудаи ташхис истифода шуданд. Ҳама намунаҳо аввал аз ҷониби як ҳавзи махсус тарҳрезишудаи ҷустуҷӯ барои Mycobacterium tuberculosis равона карда шуданд. Сипас, дар асоси маълумоти пайдарпайии TB-tNGS, модели дарахти қарор барои анҷом додани тасдиқи 5-карата дар маҷмӯаҳои омӯзишӣ ва тасдиқи навбати ташхиси лабораторӣ истифода мешавад ва ҳадди ташхиси намунаҳои плазма ва намунаҳои моеъи мағзи сар гирифта мешавад. Ҳадди бадастомада ба ду маҷмӯаи санҷишии навбати ташхиси клиникӣ барои ошкор оварда мешавад ва нишондиҳандаҳои ташхисии донишомӯз аз рӯи каҷи ROC баҳо дода мешавад. Дар охир модели ташхиси бемории сил ба даст омад.
Расми 1 диаграммаи схематикии лоихаи тадкикот
Натиҷаҳо: Мувофиқи ҳадди мушаххаси намунаи ДНК CSF (AUC = 0,974) ва намунаи cfDNA плазма (AUC = 0,908), ки дар ин тадқиқот муайян карда шудаанд, дар байни 227 намуна, ҳассосияти намунаи CSF 97,01%, хосият 95,65% ва ҳассосият ва хосият 26% буд. 86,36%. Дар таҳлили 44 намунаи ҷуфтшудаи cfDNA плазма ва ДНК-и моеъи мағзи сар аз беморони TBM, стратегияи ташхиси ин таҳқиқот мутобиқати баланди 90,91% (40/44) дар cfDNA плазма ва ДНК моеъи мағзи сар ва ҳассосият 95,45% (42/42) мебошад. Дар кӯдакони гирифтори бемории сили шуш, стратегияи ташхиси ин тадқиқот нисбат ба натиҷаҳои ташхиси Xpert намунаҳои шарбати меъда аз ҳамон беморон (28,57% VS 15,38%) нисбат ба намунаҳои плазма ҳассостар аст.
Расми 2 Таҳлили иҷрои модели ташхиси бемории сил барои намунаҳои аҳолӣ
Расми 3 Натиҷаҳои ташхиси намунаҳои ҷуфтшуда
Хулоса: Дар ин тадқиқот як усули ташхиси ҳассосии бемории сил муқаррар карда шудааст, ки метавонад як воситаи ташхисро бо ҳассосияти баландтарин барои беморони клиникии гирифтори сили олигобацилярӣ (фарҳанги манфӣ) таъмин намояд. Муайян кардани бемории сили ҳассос дар асоси cfDNA плазма метавонад як навъи намунаи мувофиқ барои ташхиси бемории сили фаъол ва менингитҳои сил бошад (ҷамъоварии намунаҳои плазма нисбат ба моеъи мағзи сар барои беморони гумонбар ба бемории сили мағзи сар осонтар аст).
Истиноди аслӣ: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? тавассути% 3Dihub
Муқаддимаи мухтасари маҳсулоти муайянкунии силҳои Макро ва Микро-Тест
Бо дарназардошти вазъияти мураккаби намунаи беморони сил ва эҳтиёҷоти гуногун, Macro & Micro-Test маҷмӯи пурраи ҳалли NGS-ро барои истихроҷи моеъ аз намунаҳои балғам, сохтан ва пайдарпайии китобхонаи Qualcomm ва таҳлили маълумот пешниҳод мекунад. Маҳсулот ташхиси сареъи беморони сил, муайян кардани муқовимат ба доруҳои сил, навъи микобактерияи сил ва НТМ, ташхиси ҳассосияти бемории сили бактериявӣ-манфӣ ва одамони сил ва ғайраро дар бар мегирад.
Маҷмӯаҳои муайянкунии силсилаи бемории сил ва микобактерияҳо:
| Рақами адад | номи маҳсулот | мундариҷаи санҷиши маҳсулот | навъи намуна | модели татбиқшаванда |
| HWTS-3012 | Агенти барориши намуна | Дар муолиҷаи моеъи намунаҳои балғам истифода мешавад, рақами рекордии дараҷаи аввалро ба даст овард, Таҷҳизоти Sutong Machinery 20230047. | балғам | |
| HWTS-NGS-P00021 | Маҷмӯаи муайянкунии миқдор Qualcomm барои бемории сили ҳассос (усули забти зонд) | Муайян кардани ҳассосияти ғайриинвазивӣ (биопсияи моеъ) барои бемории сили шуши бактериявӣ манфӣ ва гиреҳҳои мағзи сар; Намунаҳои одамоне, ки ба сирояти сил ё микобактерияҳои ғайрисил гумонбар шудаанд, тавассути метагеномикаи амиқи пайдарпай таҳлил карда шуданд ва иттилооти ошкор кардани сирояти микобактерияҳои сил ё ғайрисил ва маълумоти асосии муқовимат ба доруҳои сил микобактерияҳои сил пешниҳод карда шуданд. | Хуни периферикӣ, моеъи шустани алвеолярӣ, гидроторакс ва асцит, намунаи пунксияи фокусӣ, моеъи мағзи сар. | Насли дуюм |
| HWTS-NGS-T001 | Маҷмӯаи чопкунии микобактерия ва муқовимат ба маводи мухаддир (усули пайдарпайии амплификацияи мултиплекс) | Санҷиши чопкунии микобактерия, аз ҷумла MTBC ва 187 NTM;Муайян кардани муқовимат ба маводи мухаддир Mycobacterium tuberculosis 13 дору ва 16 макони мутацияи асосии генҳои муқовимат ба маводи мухаддирро дар бар мегирад. | Балғам, моеъи шустани алвеолярӣ, гидроторакс ва асцит, намунаи пунксияи фокусӣ, моеъи мағзи сар. | Платформаи дугонаи насли дуюм/сейум |
Нуктаҳо: HWTS-NGS-T001 чопкунии микобактерияҳо ва маҷмӯаи муайянкунии муқовимат ба маводи мухаддир (усули амплификацияи чандкарата)
Шиносоии маҳсулот
Маҳсулот ба доруҳои асосии қатори якум ва дуюм, ки дар дастурҳои ТУТ дар табобати бемории сил тавсиф шудаанд, макролидҳо ва аминогликозидҳо, ки маъмулан дар дастури табобати NTM истифода мешаванд, асос ёфтааст ва маконҳои муқовимат ба маводи мухаддир ҳама як гурӯҳи маконҳои муқовимат ба маводи мухаддирро дар феҳристи мутацияи комплексии ТУТ Mycobacterium tuberculosis, инчунин дигар сайтҳои муқовимати статистикии муқовимат ба генҳои муқовимат ва генҳои баланд гузориш додашударо дар бар мегирад. адабиёти дохилй ва хоричй.
Муайянсозии чопкунӣ ба штаммҳои NTM асос ёфтааст, ки дар дастурҳои NTM ҷамъбастшуда, ки аз ҷониби маҷаллаи чинии сил ва бемориҳои роҳи нафас нашр шудааст ва ризоияти коршиносон. Примерҳои чопкунии тарҳрезишуда метавонанд беш аз 190 намуди NTM-ро васеъ, пайдарпай ва шарҳ диҳанд.
Тавассути технологияи амплификацияи мақсадноки мултиплекси PCR, генҳои генотипсозӣ ва генҳои ба маводи мухаддир муқовимати Mycobacterium тавассути мултиплекс PCR тақвият дода шуданд ва омезиши ампликони генҳои ҳадаф, ки бояд ошкор карда шаванд, ба даст оварда шуданд. Маҳсулоти пурқувватро метавон дар китобхонаҳои насли дуввум ё насли сеюми секвенсияи баландсуръат сохтан мумкин аст ва ҳама платформаҳои пайдарпайии насли дуввум ва насли сеюм метавонанд ба пайдарпайии амиқи баланд барои ба даст овардани иттилооти пайдарпайии генҳои мавриди ҳадаф қарор гиранд. Бо муќоиса бо мутатсияњои маълуме, ки дар базаи маълумотномањои дарунсохт љойгир шудаанд (аз љумла каталоги мутатсияи комплексии ТУТ Mycobacterium tuberculosis ва иртиботи он бо муќовимат ба доруњо) мутатсияњои вобаста ба муќовимат ё њассосияти доруњои зидди сил муайян карда шуданд. Дар якҷоягӣ бо маҳлули худкушода оид ба коркарди намунаи балғам аз Macro & Micro-Test, масъалаи самаранокии пасти амплификатсияи кислотаи нуклеинӣ дар намунаҳои балғами клиникӣ (даҳ маротиба зиёдтар аз усулҳои анъанавӣ) ҳал карда шуд, то муайянкунии пайдарпайии муқовимат ба маводи мухаддир мустақиман ба намунаҳои балғами клиникӣ татбиқ карда шавад.
Диапазони муайянкунии маҳсулот
34генҳои муқовимат ба маводи мухаддир18дорухои зидди сил ва6маводи мухаддир NTM ошкор карда шуданд, фаро297маконҳои муқовимат ба маводи мухаддир; Даҳ намуди Mycobacterium tuberculosis ва зиёда аз он190намудхои НТМ ошкор карда шуданд.
Љадвали 1: Маълумот дар бораи доруњои 18+6 +190+НТМ
Афзалияти маҳсулот
Мутобиқшавии қавии клиникӣ: намунаҳои балғамро мустақиман бо агенти худмоеъкунанда бидуни фарҳанг муайян кардан мумкин аст.
Амалиёти таҷрибавӣ оддӣ аст: даври якуми амалиёти пурқувваткунӣ оддӣ аст ва сохтмони китобхона дар давоми 3 соат ба итмом мерасад, ки самаранокии корро беҳтар мекунад.
Навиштани ҳамаҷониба ва муқовимат ба маводи мухаддир: фарогирии маконҳои чопкунӣ ва муқовимат ба маводи мухаддири MTB ва NTM, ки нуктаҳои асосии нигаронии клиникӣ, чопкунии дақиқ ва муайян кардани муқовимат ба маводи мухаддир, дастгирии нармафзори мустақили таҳлил ва тавлиди гузоришҳои таҳлилӣ бо як клик.
Мутобиқат: мутобиқати маҳсулот, мутобиқ шудан ба платформаҳои асосии ILM ва MGI/ONT.
Мушаххасоти маҳсулот
| Рамзи маҳсулот | номи маҳсулот | Платформаи ошкор | мушаххасот |
| HWTS-NGS-T001 | Маҷмӯаи чопкунии микобактерия ва муқовимат ба маводи мухаддир (усули амплификацияи мултиплекс) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Вақти фиристодан: январ-23-2024